微生物农药是指以细菌、真菌、病毒和原生动物或基因修饰的微生物等活体为有效成分的农药。由于我国鼓励生物农药的研发，且生物农药登记要求相比创制的新化学农药要低很多，越来越多企业和科研机构开始研发和登记新的微生物菌株作为农药。然而新微生物农药在中国获得登记并非易事，需要克服菌株鉴定与命名、产品质量与药效、毒理和环境安全性3重挑战。